Dados do Trabalho

Título

Diversidade genômica mitocondrial de dez isolados brasileiros de Plasmodium brasilianum

Introdução

Análise recente do genoma completo de Plasmodium brasilianum, parasita de primatas não humanos (PNHs), confirmou sua proximidade filogenética com Plasmodium malariae, parasita que causa malária em humanos, com uma identidade geral de 97,3%. P. brasilianum não representa uma linhagem distinta, mas se enquadra na radiação de cepas humanas de P. malariae, surgindo após a transmissão do parasita humano para PNHs do Novo Mundo. Sendo P. malariae e P. brasilianum considerados atualmente como uma única espécie, estudos sobre diversidade genética aumentam o conhecimento da estrutura genômica desses parasitas, caracterizando a distribuição global de haplótipos. Embora dados de genoma completo sejam mais informativos, ainda são escassos e difíceis de obter para esses parasitas. Seus genomas mitocondriais (mtDNAs) são bem menores (~6 kb) e oferecem vantagens adicionais por não se recombinarem e terem polimorfismos evolutivamente neutros. Mesmo com mtDNAs quase indistinguíveis, uma análise comparativa de uma coleção maior de amostras pode acrescentar informações sobre a diversidade desses parasitas. Atualmente, existem nove sequências de mtDNA de P. malariae ou P. brasilianum que podem ser utilizadas para comparação. Entretanto, apenas duas sequências são de isolados da América do Sul e nenhuma do Brasil, onde a malária causada por P. brasilianum é amplamente distribuída, infectando muitas espécies de PNHs.

Objetivo (s)

Nesse estudo, analisamos a diversidade genética de P. brasilianum utilizando 10 sequências de mtDNA, obtidas de isolados da Região Amazônica e da Mata Atlântica.  

Material e Métodos

Bibliotecas foram preparadas com Ion Xpress Plus Fragment Library, sendo carregadas em chip Ion316 v2, e sequenciadas em Ion Torrent (PGM). Reconstruções filogenéticas foram realizadas por inferência bayesiana e modelo evolutivo GTR + G.

Resultados e Conclusão

Geramos sequências com profundidade média de 237.680 leituras por isolado. As análises filogenéticas revelam que P. brasilianum se enquadra em um clado com P. malariae, com pouca divergência. Entre as sequências existentes de P. malariae e P. brasilianum, encontramos um total de 22 Polimorfismos de Nucleotídeos Únicos (SNPs), sendo apenas dois nas nossas amostras. Um dos SNPs nas amostras brasileiras resulta em uma substituição não sinônima no gene citocromo c oxidase I. Com este trabalho, proporcionamos um aumento substancial nas sequências mtDNA disponíveis, permitindo estudos de filogenia mais precisos, contribuindo para melhor compreensão da malária como uma zoonose.

Palavras Chave

Plasmodium brasilianum; sequenciamento de nova geração (NGS); malária zoonótica; genômica comparativa.