Dados do Trabalho

Título

CARACTERIZAÇÃO GENÉTICA DE PARECHOVIRUS E COSAVIRUS EM AMOSTRAS DE GASTROENTERITE AGUDA DAS REGIÕES NORTE E NORDESTE DO BRASIL

Introdução

A gastroenterite aguda (GEA) é uma das doenças que mais acometem crianças menores de 5 anos em todo o mundo, apresentando uma alta taxa de morbimortalidade e está diretamente associada a condições de saneamento básico. Cerca de 40% dos casos de GEA permanecem sem etiologia definida, entretanto membros da família Picornaviridae, como Parechovirus (HPeV) e Cosavirus (HCoSV), são apontados como possíveis agentes causadores, contudo por possuirem uma ampla diversidade genética, faz-se necessário identificação dos genótipos associados a estes casos. 

Objetivo (s)

Diante disso, objetivou-se determinar os genótipos de HPeV e HCoSV de amostras fecais de crianças com quadro de gastroenterite aguda em estados da região Norte e Nordeste do Brasil entre os anos de 2020 e 2021.

Material e Métodos

Para isso, oito amostras positivas por RT-qPCR, sendo quatro HPeV e quatro HCoSV, foram submetidas ao Sequenciamento Genético de Nova Geração (NGS) através da metodologia de metagenômica de Shotgun utilizando o sistema Nextseq Illumina ®. As análises de bioinformática foram realizadas através do software Kraken 2 e o Banco de Dados NR – NCBI. O estudo foi submetido e aprovado pelo comitê de ética do Instituto Evandro Chagas, através do CAEE 58544722.0.0000.0019. 

Resultados e Conclusão

Das oito amostras submetidas ao sequenciamento, somente seis tiveram os genomas parcialmente recuperados, possibilitando a identificação das espécies e genótipos de três HPeV e três HCoSV. Os HPeV detectados foram classificados como pertencentes a espécie A, sendo possível diferenciar em dois genótipos, onde duas amostras foram identificadas como HPeV-4 e uma amostra como HPeV-2. Em relação aos HCoSV, foi possível identificar dois genótipos, uma amostra pertencente ao genótipo HCoSV-D e duas amostras foram identificadas como a cepa recombinante HCoSV-E/D, que apresenta baixa detecção em todo o mundo. Diante do exposto, sugere-se que as espécies HCosV E/D, HCosV D, HPeV-A do tipo 2 e 4 estão envolvidas possivelmente na patogênese da gastroenterite aguda, portanto faz-se necessário a continuidade da vigilância expandida para fomentar estudos voltados para esse eixo temático para confirmar a participação desses vírus na GEA e de outras espécies e tipos que possam estar envolvidos nessa patogênese e quais são os seus comportamentos no organismo humano.

Palavras Chave

Vigilância; Gastroenterite aguda; Picornavírus