Dados do Trabalho

Título

MONITORAMENTO GENÔMICO DO VÍRUS DENGUE NO ESTADO RONDÔNIA, AMAZONIA OCIDENTAL BRASILEIRA.

Introdução

O vírus da dengue apresenta quatro sorotipos distintos (DENV-1, DENV-2, DENV-3 e DENV-4), a complexidade da resposta imune e a possibilidade de reinfecção por diferentes sorotipos tornam o controle e a prevenção da dengue um desafio significativo para a saúde pública global, principalmente na Região Amazônica. Logo, a vigilância genômica permite a identificação precisa das variantes circulantes, ajudando a entender a dinâmica de transmissão e a evolução do virus, além de identificar rapidamente a introdução de novas cepas ou linhagens em uma região, o que é crucial para a implementação de medidas de controle.

Objetivo (s)

Monitorar a diversidade genética dos vírus da Dengue circulante no estado de Rondônia, considerando a faixa etária e sexo.

Material e Métodos

O sequenciamento foi realizado em parceria com o Laboratório Central de Saúde Pública do Amazonas. O sequenciamento foi realizado com conjuntos de iniciadores específicos, desenvolvidos pelo Centre for Arbovirus: Discovery, Diagnosis, Genomics and Epidemiology (CADDE) (https://www.caddecentre.org/protcols/). Os genomas foram sequenciados na plataforma MiSeq (Illumina) utilizando o kit de preparo de biblioteca Illumina COVIDSeq Assay e o MiSeq Reagent Kit v2 (300 cycles). Os genomas foram montados por referência e em seguida classificados em relação ao sorotipo/clado para cada vírus utilizando a ferramenta online Genome Detective - Typing Tool, e a identificação confirmada por análises filogenéticas geradas no software IQ-TREE versão 1.6.12.

Resultados e Conclusão

Os resultados da análise de 51 amostras positivas para dengue provenientes de 22 municípios de Rondônia revelam uma predominância dos vírus dengue sorotipo 1 (DENV-1) e sorotipo 2 (DENV-2), com 17 e 28 amostras, respectivamente. A média de cobertura de sequenciamento dos genomas de DENV-1 foi de 84,9%, com variações significativas entre 0,8% e 94,3%, e esses genomas foram classificados como pertencentes ao genótipo V do DENV-1. Em relação ao DENV-2, a média de cobertura de sequenciamento foi de 56%, e todas as amostras foram identificadas como pertencentes ao genótipo II Cosmopolitan do DENV-2. Conclusão: Esses dados indicam a presença de múltiplos variantes de dengue na região, com uma maior diversidade genotípica e variabilidade na cobertura de sequenciamento do DENV-1 em comparação ao DENV-2. Essas informações são cruciais para o entendimento epidemiológico e para o planejamento de estratégias de controle e prevenção da dengue em Rondônia.

Palavras Chave

Arboviroses; dengue; sorotipos