Dados do Trabalho

Título

Detecção e genotipagem de Norovírus humano em águas superficiais provenientes da Baía do Guajará e esgoto tratado, Belém, Pará

Introdução

A água é um recurso vital para a vida na Terra e sua qualidade é fundamental para prevenir doenças, devendo ser livre de patógenos e outras substâncias que afetem a saúde humana. Os norovírus (NoV) são associados a casos esporádicos e surtos de doença diarreica, e podem ser detectados em matrizes aquáticas por meio do despejo de resíduos de esgoto em rios, lagoas e mar. 

Objetivo (s)

O objetivo deste estudo foi detectar e genotipar os NoV em águas superficiais provenientes da Baía do Guajará e esgoto tratado, na cidade de Belém, Pará, no período de julho de 2021 a fevereiro de 2023.

Material e Métodos

As amostras de água coletadas foram concentradas por floculação orgânica com leite desnatado acidificado e extraídas pelo método da Sílica/Isotiocianato de Guanidina. O RNA extraído foi submetido à RT-qPCR (junção ORF1-ORF2) utilizando iniciadores e sondas específicos para NoV genogrupos GI, GII e GIV. Semi-nested/nested RT-PCR foi realizado para os três genogrupos nas amostras detectáveis por RT-qPCR. Os amplicons foram purificados, quantificados por fluorometria e sequenciados por SANGER em sequenciador automático. A correlação de Sperman foi utilizada para avaliar a correlação entre detecção viral e concentração de coliformes termotolerantes nas amostras analisadas.  

Resultados e Conclusão

Um total de 143 amostras de água superficial foram coletadas e testadas por RT-qPCR obtendo-se um percentual de detecção para NoV de 14,7% (21/143), dos quais 52,4% (11/21) foi classificada como GI; 19% (4/21) como GII; 14,3% (3/21) como GI+GIV; 9,5% (2/21) como GI+GII; 4,8% (1/21) como GI+GII+GIV. Das 21 amostras detectáveis para NoV por RT-qPCR apenas 5 foram detectáveis por Semi-nested ou Nested RT-PCR, sendo 60% (3/5) para NoV GIV (região N/S do capsídeo viral) e 40% (2/5) para NoV GI (região A da polimerase). Após sequenciamento nucleotídico, as 3 amostras detectáveis para NoV GIV foram classificadas como pertencentes ao genótipo GIV.NA1. Não houve correlação entre a detecção de NoV e níveis de coliformes termotolerantes nas amostras avaliadas (Correlação de Sperman, p= 0,44). A detecção de NoV nas amostras avaliadas demonstra haver fontes de contaminação fecal nas áreas de estudo, uma vez que este patógeno é excretado em altas concentrações pelas fezes de indivíduos infectados. Estes achados reforçam a necessidade da preservação dos corpos hídricos nos centros urbanos por meio de sistemas de tratamento de esgoto eficazes, que garantam a eliminação de vírus e bactérias nos resíduos antes de seus lançamentos em águas superficias.

Palavras Chave

Norovírus; água; Esgoto; RT-qPCR; Belém.