Dados do Trabalho

Título

VIGILÂNCIA GENÔMICA E RESPOSTA RÁPIDA LABORATORIAL PARA SARS-CoV-2

Introdução

A pandemia de COVID-19, emerge como uma das mais significativas crises de saúde pública. A contenção eficaz da disseminação viral tem se mostrado um desafio global, requerendo uma compreensão abrangente da biologia e da epidemiologia subjacentes ao SARS-CoV-2 para a formulação de estratégias preventivas e terapêuticas.

Objetivo (s)

Fornecer resposta rápida de vigilância genômica no estado de Mato Grosso, utilizando sequenciamento de nova geração.

Material e Métodos

As bibliotecas foram preparadas utilizando o protocolo Illumina COVIDSeq (Illumina Inc, EUA), e os dados brutos gerados no formato fastQ foram processados ​​usando o DRAGEN COVIDSeq Test Pipeline (Illumina Inc.) na plataforma Illumina DRAGEN v3.5.9 de acordo com o protocolo padrão.  Visando elucidar a dinâmica epidemiológica do SARS-CoV-2 e monitorar a emergência de novas subvariantes e suas respectivas mutações.  Este estudo encontra-se aprovado pelo Comitê de Ética em Pesquisa sob o parecer número CAAE:65072322.3.0000.5166. 

Resultados e Conclusão

Identificou-se a subvariante JN.2.5 do vírus da COVID-19, a qual foi prontamente submetida ao banco de dados global GISAID pelo Laboratório Central de Saúde Pública de Mato Grosso (LACEN-MT), representando o primeiro registro desta subvariante no território brasileiro. Adicionalmente, identificamos as cepas JD.1.1, JD.1.1.1, GK.1.1, JN.1, JN.1.1 e JN.1.3, todas pertencentes à linhagem Ômicron. Notavelmente, a subvariante JN.2.5 já foi detectada em outros países, incluindo Canadá, França, Polônia, Espanha, Estados Unidos, Suécia e Reino Unido. Salientamos a importância da vigilância genômica contínua como uma ferramenta fundamental para monitorar a diversidade viral e responder adequadamente às mudanças epidemiológicas. Os achados deste estudo fornecerão subsídios valiosos para a formulação de políticas de saúde pública e para o direcionamento de intervenções específicas no combate à pandemia de COVID-19. O entendimento aprofundado das características e do impacto da subvariante favorece o enfrentamento dos desafios futuros que esta enfermidade possa apresentar por meio da resposta da vigilância genômica. A capacidade de identificar e caracterizar rapidamente novas variantes do vírus, como a JN.2.5, permite uma intervenção ágil e eficaz no controle da disseminação da doença. A vigilância genômica contínua permite uma resposta rápida às mudanças epidemiológicas, fornecendo informações para a tomada de decisões em saúde pública e para o desenvolvimento de estratégias de prevenção e controle mais eficientes.

Palavras Chave

vírus; Laboratório; Genômica.