Dados do Trabalho

Título

AVALIAÇÃO IN SILICO DE NOVOS CANDIDATOS ANTIVIRAIS TIAZOLIDÍNICOS HALOGENADOS CONTRA O SARS-CoV-2 E O ZIKA VÍRUS

Introdução

Muitas doenças virais podem representar emergências mundiais de saúde. Entre elas, a infecção pelo vírus da Síndrome Respiratória Aguda Grave Coronavírus 2 (SARS-CoV-2) e pelo Zika vírus (ZIKV). Atualmente, não existem terapias específicas e de baixo custo para ambos os vírus. Entre os compostos sintéticos com propriedades antivirais, destaca-se a tiazolidina-2,4-diona (TZD). Alguns alvos virais como a protease principal (Mpro) do SARS-CoV-2 e a metil-transferase (NS5) do ZIKV são considerados promissores, pois são essenciais para a replicação viral.

Objetivo (s)

Esse trabalho propôs avaliar por meio do docking molecular a afinidade entre os ligantes da série ZKG e as proteínas Mpro e NS5.

Material e Métodos

Os derivados ZKG 1-25 foram desenhados no Chemdraw ultra 12.0. Posteriormente, as estruturas foram plotadas no Avogadro e otimizadas através da ferramenta Auto Optimization Tool. Os alvos foram obtidos a partir do Protein Data Bank (PDB). Foram selecionadas as estruturas PDB ID: 6W63 (Mpro) e PDB ID: 5WZ1 (NS5). O docking molecular foi realizado pelo DockThor-VS e os resultados foram analisados pelo Discovery Studios Biovia.

Resultados e Conclusão

A interação dos ligantes ZKG com a NS5 identificou cinco compostos com maior afinidade, ZKG20 (-9.1kcal/mol), ZKG15 (-8,9kcal/mol), ZKG8 (-8,9kcal/mol), ZKG9 (-8,9kcal/mol) e o ZKG5 (-8,9kcal/mol). O ZKG-20 obteve melhor interação e apresentou duas ligações de hidrogênio com Lys100 e Ser51, ligações de carbono hidrogênio, ligações hidrofóbicas e uma ligação eletrostática. A carbonila presente na TZD atuou como receptora de hidrogênio. O halogênio e o  anel aromático foram responsáveis por grande parte das interações hidrofóbicas. Cinco ligantes demonstraram maiores afinidades com a Mpro: ZKG8 (-8.7kcal/mol), ZKG24 (-8.6kcal/mol), ZKG23 (-8.5kcal/mol), ZKG-20 (8.4kcal/mol), ZKG-18 (-8.4kcal/mol). Um estudo  realizado  por Guedes et al. (2020) utilizou o mesmo método computacional e foi possível identificar que o ligante ZKG8 apresenta melhores resultados que a amodiaquina (-8.2kcal/mol), ritonavir (-8.70kcal/mol), dentre outros. As ligações com a Mpro indicaram que os ligantes ZKG24, ZKG23 e ZKG18 realizam interação com o resíduo Cys145. Entre eles destaca-se o ZKG23 que realizou ligações Pi-Sigma com Cys145, além de duas ligações de hidrogênio com o Asn142, Pi-Doador de ligação de hidrogênio e Pi-Ânion com Glu166.  Logo, conclui-se que as moléculas da série LPSF/ZKG se apresentam como candidatos promissores na interação com a NS5 e a Mpro.  

Palavras Chave

docking molecular; ZIKV; SARS-CoV-2; Química medicinal; Química computacional