Dados do Trabalho

Título

Tipagem de clones de alto risco de A. baumannii resistentes a carbapenêmicos por espectroscopia de infravermelho com transformada de Fourier

Introdução

Acinetobacter baumannii resistente aos carbapenêmicos é um patógeno de prioridade critica de acordo com a Organização Mundial de Saúde, associado a pior prognóstico clínico, e endêmico nos hospitais brasileiros. A estrutura clonal de A. baumannii é composta pelos denominados clones de alto risco, que se limitam aos complexos clonais 1, 2, 15, e 79, todos de distribuição global. A identificação da clonalidade permite monitorar a dispersão dos diferentes clones, que podem apresentar certas especificidades em relação à suscetibilidade antimicrobiana e potencial de causar surtos. Atualmente, os métodos usados para tipagem de A. baumannii dependem de PCR e/ou sequenciamento gênico. A espectroscopia de infravermelho com transformada de Fourier (FT-IR), apesar de ser utilizada há muitos anos em outras aplicações, tem ganhado destaque na microbiologia por permitir tanto a classificação (em sorogrupos, por exemplo) quanto a caracterização da clonalidade de isolados bacterianos.

Objetivo (s)

Neste estudo, objetivamos avaliar a capacidade do IR Biotyper (Bruker Daltonics, Bremen, Alemanha) em identificar os principais clones de alto risco de A. baumannii. 

Material e Métodos

Para tanto, foram selecionados 13 isolados representativos dos complexos clonais 1, 2, 15, e 79. Estes isolados foram previamente caracterizados por MLST (Instituto Pasteur) ou por 3LST para identificação dos complexos clonais. Para o FT-IR cada isolado foi submetido a 15 coletas, representadas por três replicatas biológicas (realizadas em dias distintos e consecutivos) e cinco replicatas técnicas (realizadas para cada isolado em todas as replicadas biológicas). Os espectros adquiridos foram analisados por três métodos estatísticos: dendrograma UPGMA; principal componente analysis (PCA) + UPGMA; linear discriminant analysis (LDA) + UPGMA. 

Resultados e Conclusão

As corridas foram validadas com utilização dos controles internos. As replicatas técnicas foram agrupadas entre si, indicando validação de cada replicata biológica. Os três métodos de análise puderam diferenciar com clareza os diferentes complexos clonais de A. baumannii analisados. Pelo método de clusterização dendrograma UPGMA, um valor de 0.927 foi suficiente para agrupar os clones de alto risco. Deste modo, a técnica de espectroscopia de infravermelho com transformada de Fourier apresenta potencial de ser utilizada para subtipagem dos principais clones de A. baumannii causadores de infecções relacionadas à assistência à saúde, auxiliando a elucidação e controle de surtos. 

Palavras Chave

tipagem; infecção hospitalar; infravermelho; Epidemiologia; FT-IR